女の子ではるきちゃんでも全然違和感ないですよ。
ただ、遥來は少し読みにくい印象です。

希や季などが読みやすいと思いますが、上のお子さんの「來」を使いたいんですよね。
さらに男の子っぽい名前となるとけっこう限られてきますね。

遥來（はるき）は少し読みにくいですが、全然読めないこともないので、多少の読みにくさは許容できるのであれば良いのではないかなと思います。

來を使った名前なら

未來（みらい、みく、みき）
奏來（そら）

も中性的かなと思いました。
中性的ではないですが、咲來（さら）も。